Минфин в письме от 20.01.2020 г. № 03-11-11/2644 пояснил, что возможность применения налогоплательщиком специального налогового режима НПД не ставится в зависимость от наличия или отсутствия у налогоплательщика статуса налогового резидента Российской Федерации.
Получается, что вы можете сдавать квартиру в России как самозанятый, даже если проживаете в России меньше 6 месяцев в году.