Регистрация статуса самозанятого вовсе не означает увольнение с текущего места работы. Плательщики НПД могут спокойно продолжать работу по трудовому договору и договорам ГПХ.
А если на момент регистрации самозанятый не был официально трудоустроен, то он может заключить трудовой договор с новым работодателем.
Главное помнить, что после увольнения самозанятый не может оказывать услуги бывшему работодателю в качестве плательщика НПД в течение 2-х лет с момента прекращения трудовых отношений.